首先做好数据库备份，然后打包网站，下载到本地清除。因为如果不是独立服务器的话，没办法在空间上做到完全清除。

在本地搭建好网站，然后下载木马查杀软件，安全狗或者360主机卫士对整个网站进行查杀。

清除完成后，检查下后台系统账号有没有被添加别的账号，如果没有的话，修改管理员账号和密码，建议修改为是否织梦首页模板复杂的。后台地址也要进行修改。

如果织梦补丁不是最新，建议将补丁全部更新。（注意，如果是二次开发过的网站请谨慎操作）

所有修改完成后，备份数据，打包。将服务器上的网站全部文件打包或者直接删除，将本地清除完的文件织梦模板免费全部上传并安装。

织梦cms的安全如果做好设置的话是绝对不会被黑的。我之前有写过一篇，如何将织梦安全做到极致，有时间可以看下。希望能够帮到您。